この時「サービス」という項目で丸め分をマイナスして計算します。 ですが、この丸めのマイナス金額は消費税の対象額に反映されていませんので、インボイス対応時は、5円丸め/10円丸めの機能を使用しないことを推奨します。
インボイス(適格簡易請求書)について(BT-4000)